2010/07/05

[GAMESS] diazomethane

メチル化剤等として有機合成に使われる(ただし毒性あり)ジアゾメタン。

↓モデリングして分子力場計算で構造を最適化すると…折れ曲がってます(たぶん間違った構造)。

100705_0.png

得られた座標データに計算パラメータを加えて、DFT計算。B3LYP/6-31G(d)。

ここから入力ファイルの中身-----
! DFT, B3LYP/6-31G(d), optimization
$CONTRL DFTTYP=B3LYP SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE $END
$SYSTEM TIMLIM=600000 MEMORY=80000000 $END
$STATPT OPTTOL=0.0001 NSTEP=200 PROJCT=.FALSE. $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
$GUESS GUESS=HUCKEL $END
$SCF DIRSCF =.TRUE. $END

$DATA

C1
C 6.0 -3.5062850794 3.5210793468 0.0408353170
N 7.0 -2.5781507499 2.8632400298 0.5634773115
N 7.0 -1.6346723394 3.3535608528 0.8902702351
H 1.0 -3.4317177932 4.6092667170 -0.1184894116
H 1.0 -4.4219991822 3.0015812836 -0.2686474484
$END
ここまで-----

↓HOMO (-5.90 eV)。やはり直線状の構造でした。

100705_1.png

↓LUMO (-1.20 eV)。

100705_2.png

モデリング: Avogadro
http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page

軌道計算: GAMESS-US
http://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/

軌道表示: MacMolPlt
http://www.scl.ameslab.gov/MacMolPlt/

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