2010/07/06

[GAMESS] trimethylsilyldiazomethane

ジアゾメタンの代替として有機合成に使われるトリメチルシリルジアゾメタン。

↓モデリングして分子力場計算で構造を最適化すると…ジアゾメタンと同じく、曲がってました。

100706_0.png

得られた座標データに計算パラメータを加えて、DFT計算。B3LYP/6-31G(d)。

ここから入力ファイルの中身-----
! DFT, B3LYP/6-31G(d), optimization
$CONTRL DFTTYP=B3LYP SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE $END
$SYSTEM TIMLIM=600000 MEMORY=80000000 $END
$STATPT OPTTOL=0.0001 NSTEP=200 PROJCT=.FALSE. $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 $END
$GUESS GUESS=HUCKEL $END
$SCF DIRSCF =.TRUE. $END

$DATA

C1
Si 14.0 -8.8566933285 1.5002915810 -0.0509405067
C 6.0 -7.0363636916 1.9081656074 -0.1162174194
C 6.0 -9.8472844728 3.0841892299 0.0838504429
C 6.0 -9.1991354679 0.4179617066 1.4384486976
C 6.0 -9.3408792803 0.5898979621 -1.6137373542
N 7.0 -6.7259076815 2.6701355531 1.0481225144
H 1.0 -6.7926242282 2.4969697649 -1.0049368740
H 1.0 -6.4253042278 1.0002200468 -0.1245381427
H 1.0 -9.6293599827 3.6021095454 1.0225274977
H 1.0 -10.9203442337 2.8721164454 0.0544418481
H 1.0 -9.6103791731 3.7606947647 -0.7425696000
H 1.0 -8.9522469484 0.9420102949 2.3665742329
H 1.0 -8.6036809143 -0.4989887235 1.3955403038
H 1.0 -10.2556329613 0.1367158888 1.4770449761
H 1.0 -9.1346052910 1.2009508699 -2.4975321076
H 1.0 -10.4082040768 0.3494320808 -1.6069717817
H 1.0 -8.7809034367 -0.3453256006 -1.7070955760
N 7.0 -6.4678666386 3.2546503813 1.9288267484
$END
ここまで-----

↓HOMO (-5.69 eV)。炭素−窒素−窒素のところがまっすぐになりました。

100706_1.png

↓LUMO (-0.87 eV)。HOMO, LUMO共にジアゾメタン(5.90 eV/1.20 eV)よりも高く、HOMO-LUMO準位差(4.82 eV/4.70 eV)は大きくなってます。

100706_2.png

モデリング: Avogadro
http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page

軌道計算: GAMESS-US
http://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/

軌道表示: MacMolPlt
http://www.scl.ameslab.gov/MacMolPlt/

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